上海精准医学研究院是上海市教委IV类高峰学科建设项目,由上海交通大学医学院牵头、依托上海交通大学医学院附属第九人民医院进行实体化建设的上海市科技协同创新中心,研究院位于浦东新区锦尊路115号的上海交通大学医学院附属第九人民医院九院科教园区,于2017年12月20日揭牌投入正式运行。
上海精准医学研究院由国家高层次人才雷鸣研究员任执行院长,已建成电镜平台、生物成像平台、数据计算与分析平台、组学平台、蛋白质平台、化学生物学平台等六大平台;具备蛋白质自动化制备表征能力、高分辨结构解析能力、多组学分析能力、高分辨生物成像能力、高性能计算能力的综合技术平台;聚焦干细胞与再生医学、组织工程、病原微生物、生殖与遗传发育、肿瘤与代谢性疾病、组学、结构生物学、生物信息学等与精准医学密切相关的研究领域。上海精准医学研究院计划在五年内引进10-15个独立研究组组长,整体人员规模达到120人左右,成为有全球影响力的精准医学研究基地。
课题组简介:
癌症源发于正常细胞的基因突变累积,并在基因表达的定向调控下,最终演化为生长不受控的一类细胞。本课题组主要利用原代细胞CRISPR/Cas基因编辑系统及转基因小鼠模型等手段,结合外显子/单细胞测序及单细胞活体成像技术,研究基因突变和表达调控如何相互协作推动肿瘤恶性进展;同时,基于人源性组织异种移植瘤(PDX ),细胞系(PDC )及类器官(PDO )等模型开展靶点确证及耐药机制研究。课题组具体研究方向如下:
1)解析癌前病变到恶性肿瘤的突变与非突变进化机制,发现肿瘤早期诊断和预后判断的分子标志物;
2)研究肿瘤表型可塑性参与肿瘤转移和耐药的分子机制;
3)聚焦黏膜/肢端黑色素瘤等中国难治性恶性黑色素瘤亚型的靶点研究及药物筛选。
目前,实验室首次通过对正常黑色素细胞进行基因编辑模拟黑色素瘤的发生过程,并发现抑癌基因CDKN2A缺失是黑色素瘤获得表型可塑性和侵袭转移能力的核心事件。另外,实验室还发现,细胞因子IL6受体家族的应激性转录激活是实体瘤对组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂产生耐药的关键机制。研究组长曾汉林的相关工作发表在Cancer Cell,Nature, Journal of Investigative Dermatology,Nature Communications等学术期刊上,其中Cancer Cell发表两篇一作文章。实验室将运用现有技术体系在包括恶性黑色素瘤及头颈部鳞癌等实体肿瘤中深入开展肿瘤恶性转化的演进机制,并探索肿瘤可塑性参与肿瘤转移和耐药分子机制研究。