北京大学新结构经济学研究院以深化新结构经济学的研究、推广和运用为目的，开展和新结构经济学相关的基础研究、研究队伍建设、人才培养、数据库建设、学术交流与智库建设等方面的工作；引导中国和其他发展中国家的专家学者和青年学子以及迫切希望推动本国长期经济发展的政府和知识精英，尽早掌握运用新结构经济学的理论，摆脱基于发达国家经验的主流发展理论的束缚，探索出一条适合各个发展中国家自身特点的现代化之路，引领国际学术思潮。