自然资源部第二海洋研究所是国际知名的综合性海洋研究所，入选科技部 创新人才培养示范基地 ，建有1个国家重点实验室、与浙江省共建浙江省海洋科学院、三个自然资源部重点实验室、两个自然资源部野外科学观测站，拥有杭州本部和临安、舟山两个基地，主持两条4000吨级科考船的运行工作，培养出了6名院士和一大批国家省部级人才。杭州本部位于杭州市保俶北路36号，距离西湖3公里，公交自行车免费直达。
SOED国家重点实验室，汇集了包括三位院士在内的近100名科研队伍，主要致力海洋动力和生态环境研究、短期气候变化与大洋环流、卫星遥感等科学与应用研究，服务国家海洋环境保障和前沿观测技术的重大需求。为了加强部重大任务的实施力度，现公开招聘若干名博士后加入研究团队。
